Cell Res：杭州基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合碱基和丝氨酸 DNA 组成的特别核酸构件，在原核和真核生物的遗传物质中会特有种广泛且普遍存在。R-loop 在很多关键因素的生物学过程中会造就极为重要系统，包括染色质词句、mRNA抑制、DNA 损伤修复以及遗传物质保持稳定性等，但其如何被粗略抑制的有助于由此可知不清楚。m6A 词句作为旅行者 RNA 上丰度三高的词句类型，广泛策划哺乳动物的生殖、免疫细胞、干细胞更新、脂肪分化、以及生成和转到等全人类过程。然而，迄今为止由此可知不清楚 m6A 是否能作为 R -loop 中会 RNA 成份的本源特征来抑制 R -loop 低水平，进而造就各种生物学系统。钱学森成都遗传物质研究成果所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文的团队合作研究成果，发现 m6A 能保持稳定 R-loop 的呈现出，进而抑制突变mRNA的理论上停止。这一成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》主旨于 10 月 12 日该网站发表于《细胞研究成果》（Cell Research）周报。研究成果的团队首先通过斑点分子构件性状和免疫细胞荧光关键因素技术，发现敲低 m6A 甲基转到酶 METTL3 贞着降低 R -loop 低水平，且该抑制作用依赖于 METTL3 甲基转到酶活性。随后，的团队成员运用高效反应物色谱联合铯关键因素技术，发现相比之下于DNA混合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 成份有更氟化物的 m6A 词句。进一步运用基于丝氨酸 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合碱基免疫细胞共沉淀高通量高通量关键因素技术（ssDRIP-seq），发现上调的 R -loop 主要氟化物在mRNA停止区域内，R-loop 巨大变化程度与 m6A 的距离和词句低水平系统性。为了追寻 m6A 对 R -loop 抑制的生物学系统，研究成果的团队绘制了 RNA 聚合酶mRNA启动子的高分辨率图谱，并在 MYC、ACTIN 突变上进行多种mRNA活性测定，发现 m6A 倡导 R -loop 呈现出是mRNA停止阶段的关键因素步骤，可以防止 RNA 聚合酶的mRNA通读。最终，的团队成员构建了针对mRNA通读的报告突变系统，通过 m6A 词句启动子的突变进一步证实 m6A 对于 R -loop 呈现出及mRNA停止的关键因素作用。该研究成果发现了 m6A 甲基化词句的共mRNA抑制系统，揭示了 RNA 甲基化词句对染色质构件的负面影响，以及 R-loop 构件中会的 RNA 成份被词句后对其自身保持稳定状态的抑制有助于，阐释了 m6A 通过保持稳定 R-loop 而倡导mRNA正常停止的成因，为进一步研究成果 m6A 与 R-loop 的抑制有助于和相应生物学系统提供者了基本的关键因素技术和理论依靠。该研究成果取得了中会国科学院策略性先期高科技专项、发展中国家自然科学以及发展中国家重点制造计划书等基金资助。原始注解：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).