Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化转录 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合末端和单末端 DNA 组合而成的特殊核酸内部结构，在噬菌体和激酶有机体的线粒体里面栖息于广泛应用且普遍存在。R-loop 在很多关键的有机体学过程里面把握重要前提，包括染色质润色、转录依赖性、DNA 破损修复以及线粒体耐久性等，但其如何被精确依赖性的前提亦然不清楚。m6A 润色作为信使 RNA 上丰度最高的润色类型，广泛应用参与哺乳动物的发育、免疫、肿瘤肝细胞备份、脂肪转变、以及生成和移到等生命过程。然而，以外亦然不清楚 m6A 是否能作为 R -loop 里面 RNA 等量的本源构造来依赖性 R -loop 程度，进而把握各种有机体学前提。清华大学北京线粒体深入研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前铭设计团队合作深入研究，见到 m6A 能保持稳定 R-loop 的呈现出，进而依赖性蛋白质转录的有效率停止。这一科技成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》主旨于 10 月 12 日应用软件发表于《肝细胞深入研究》（Cell Research）杂志。深入研究设计团队首先通过条纹分子杂交和免疫荧光电子技术，见到敲低 m6A 乙基移到酶 METTL3 显着增高 R -loop 程度，且该依赖性作用依赖于 METTL3 乙基移到酶活性。随后，设计团队成员透过高效相态色谱联合质谱电子技术，见到相较于染色体联结的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 等量有更加氟化物的 m6A 润色。全面透过基于单末端 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合末端免疫一共沉淀数据采集测序电子技术（ssDRIP-seq），见到下调的 R -loop 主要氟化物在转录停止区域内，R-loop 变化程度与 m6A 的英哩和润色程度相关。为了探寻 m6A 对 R -loop 依赖性的有机体学前提，深入研究设计团队绘制了 RNA 蛋白酶转录碱基的高分辨率图谱，并在 MYC、ACTIN 蛋白质上进行多种转录活性验证，见到 m6A 促成 R -loop 呈现出是转录停止前期的的有，可以防止 RNA 蛋白酶的转录通读。最终，设计团队成员构建了针对转录通读的报告蛋白质系统，通过 m6A 润色碱基的乙基化全面证实 m6A 对于 R -loop 呈现出及转录停止的关键作用。该深入研究见到了 m6A 磷酸化润色的一共转录依赖性前提，了解到了 RNA 磷酸化润色对染色质内部结构的影响，以及 R-loop 内部结构里面的 RNA 等量被润色后对其自身二阶的依赖性前提，阐释了 m6A 通过保持稳定 R-loop 而促成转录正常停止的现象，为全面深入研究 m6A 与 R-loop 的依赖性前提和也就是说有机体学前提提供了基本的电子技术和观点支柱。该深入研究取得了里面国科学院战略性先导科技专项、国家所科学以及国家所综合研发计划等基金资助。类似出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).